S и R отличаются только одним.
R использует две микросхемы для SP и LP а S имеет оба формата в одной микросхеме.
По звучанию одно и то же.

И цифры моделей я вам привел лишь чтобы показать как расшифровываются обозначения моделей. А какая будет звучать лучше и какая хуже зависит даже не от версии АТРАК. Версия алгоритма АТРАК влияет только в режиме записи.