Что за изолятор? Какие микры применяются? Скорей всего adum4160?
Первое с чего стоит начать, это с рассмотрения питания этого самого изолятора. Ведь для того он и служит, для развязки питания и помехогашения сигнальной цепи. Каким образом организована стабилизация этого изолятора? Какие транзисторы, какие конденсаторы, или МС стабилизаторы.