не нужно велосипед изобретать - Cool edit (Adobe Audition), Sound Forge, Wavelab. Хотя, по большому счёту, это всё не важно, если не используется дизеринг ,а редакция сложнее вырезать-вставить.
Т.е. та, программа, которая красивее для тебя самого/удобнее. Потому, что задача сводится к захвату после АЦП и записи в что то несжатое на диск.