Ну вы даете, аналоговое подключение никак не влияет на компьютер, вот если бы усилитель был устройством подключаемым скажем по USB, можно было бы что-то говорить, а так...
Могу предположить, что возможно проблема кроется в звуковой плате или драйверами, возможно конфликт по PCI-шине... много вариантов
