Перекрестные помехи - это взаимные наводки из одного канала на другой. Возникают из-за паразитных емкостных и индуктивных связей, например, взаимные наводки сигналов от рядом идущих на печатной плате сигнальных шин обоих каналов.
Чтобы добиться минимального уровня перекрестных помех переделывают платы (меняют топологию), применяют экраны, экранируют провода и т.д.