Можно предположить, что по USB 3.0 должно быть "лучше", поскольку интерфейс более скоростной, и USB 3.0 контроллеры должны собственно обеспечивать меньший выходной джиттер и работать с бОльшим входным. Скорее всего это справедливо и для девайсов с USB 2.0 включенных в хост с USB 3.0