Возможно причина в следующем... Даже если разорвать все прямые земляные связи каналов, останутся паразитные связи в виде емкостной связи между катушками в ТС. То есть между земляными точками каналов будет какая-то дельта напряжений. В случае подачи полезного сигнала на один из каналов, земля в этом канале начнёт дрейфовать, относитетельно земли другого канала. При объединении земель двух каналов на входной стороне, это может привести к прямому проползанию помехи из одного канала на вход другого. А именно вход более чувствительный к подобным раздражителям.
Думаю потому, в серийных УМЗЧ, чаще всего именно силовые земли каналов, жестко связывают между собой и уравнивание потенциалов земли в меньшей степени дёргает слабосигнальную землю.