Когда Вы располагаете груз на колонку со стойкой, то смещаете центр тяжести вверх и при действии горизонтальной силы (движение диффузора) ловится НЧ резонанс.
Естественно, в противофазе...
Так что так поступать не желательно. Если сильно хочется надо тот блин хотя бы на дно ящика положить.
Меняется общая масса колебательной системы, а следовательно и частоты основного и вторичных резонансов, и пофиг куда кирпичину ложить.
Вариантов два либо акустически "мертвый" корпус, либо корпус с "своим звуком" но этот звук обязательно должен быть вписан в общую АЧХ АС. Если меняется корпус АС это тянет за собой перенастройку этих АС, исключением является тот случай когда меняя корпус мы перенастраиваем всю нашу аудиосистему и эта перенастройка удачно вписывается в наше восприятие звука.