Не по железу мерять нужно. Там довольно велико емкостное сопротивление между железом и первичкой, пробником зарегистрировали, а влияние на электронику малое. Мерять нужно по земляной цепи питания. Связь между первичкой и вторичкой (или экранной обмоткой. А это как раз наоборот с с результатом измерения по железу изолированному от общего провода. Так что у вас все одинаково сфазировано